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生成式AI快速展望三维基因组结构

发布日期:2025-02-11 11:37    点击次数:76

  好意思国麻省理工学院化学家们诈欺生成式东谈主工智能(AI)时代,修复出一种可快速展望三维基因组结构的新模子。新模子能在几分钟内展望出数千种结构,速率远超现存的实际分析才气。盘考服从发表于最新一期《科学发达》杂志。

  东谈主体每个细胞皆含有疏通的遗传序列,但每个细胞只抒发其中一部分基因。这种细胞特异性的基因抒发形态确保了不同类型细胞之间的各异,而这些抒发形态部分取决于遗传物资的三维结构。

  新模子名为ChromoGen,旨在从底层DNA序列启航,展望三维基因组结构。它包括两个构成部分,第一部分是一个深度学习模子,投资交易大略“读取”基因组,分析编码在DNA序列和染色质可拜谒性数据中的信息;第二部分是一个生成式AI模子,经过教学后大略展望出物理上准确的染色质构象。

  教学该模子所用的数据集包括稀零1100万个染色质构象,这些数据开端于对16个东谈主类B淋巴细胞系单细胞进行的实际。

  ChromoGen模子能灵验地捕捉序列—结构联系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种荒谬无序的分子,并吞个DNA序列不错产生很多不同的构象。这种才气不仅大大加快了三维基因组结构的展望流程,也为久了盘考基因组的三维组织若何影响细胞的基因抒发形态和功能提供了有劲器具。

  这一冲破性时代有望匡助科学家更快地荟萃基因调控机制,促进疾病调整和生物时代限制的向上。




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